Gemäß ihrer Verfassung verfolgt die Stiftung Pfefferwerk folgende sechs Stiftungszwecke:
- Umweltschutz
- Denkmalschutz
- berufliche Bildung und Volksbildung
- generationsübergreifende Gemeinwesenarbeit (darunter Kinder- und Jugendhilfe, Altenhilfe, Wohlfahrtspflege, mildtätige Zwecke)
- Kultur
- Völkerverständigung.